抱持着赞助他人而化身魔法少女，与此同时却必需背负着残酷的命运。在连续不断的战斗中，仁慈的美树沙耶加（喜多村英梨 配音）彻底耗尽自己的生命。当她的尸身被晓美焰（斋藤千和 配音）和佐仓杏子（野中蓝 配音）带回时，令她的密友鹿目圆（悠木碧 配音）感遭到史无前例的哀痛与痛苦。而从丘比（加藤英美里 配音）那里据说到魔法少女的宿命之说，不由让她遭到史无前例的触动。在杏子的发起下，小圆决议救助沙耶加，而她们行将与最强的魔女之夜（水桥香织 配音）碰面。有关魔女的前程与生命，她们走上一条阴险非常的道路……
本片为魔法少女的戏院版，分三部上映，由TV版12话重新编集而成。
