在可见的将来，人类有时发明了被喻为之谜的“盖塔射线”，可是无人知道，那将会是世界末日的起头……由于INVADER突然来袭，月球在转眼之间被占领，跟着，它们的魔爪诡计伸展到地球。人类用高科技的结晶——“超级机械人”，经过长达十年的“月世界战争”，胜利把恐怖的侵犯者消灭了，可是…… 早乙女博士以未开发胜利的『三一全能侠』迎击反被击溃!一方面博士着手开发『新·三一全能侠』；另一方面，认为必需找到3位适合的驾驶员....
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