延续前一集的剧情，狮子亚历克斯（本·斯蒂勒 Ben Stiller 配音）、斑马马蒂（克里斯·洛克 Chris Rock 配音）、长颈鹿迈尔曼（大卫·休默 David Schwimmer 配音）、河马格洛里亚（贾达·萍克·史姑娘 Jada Pinkett Smith 配音）以及企鹅们，为了能离开马达加斯加岛回到五光十色的纽约，对一架破旧的出事飞机进行维点窜造，并胜利起飞。当朋友们曾经起头庆贺终于能够回到纽约时，飞机却不测降落，迫降到了非洲大草原上。在这儿，狮子亚历克斯终于见到了它的怙恃。可是由于生活习性上太多纷歧样，而且言行举止各别，使得这群纽约来的动物们显得格格不入。这群往日纽约中心公园的动物明星们，在这野外艰难的环境中应当怎样办？虽然在这儿遇见了自己的同类，但由于习性差别，使得自己没法完整融入他们的群体。为了能融入环境，与同类们建立良好的关系，朋友们都是发挥各类招式，笑料百出。
