X档案关闭后，穆德（David Duchovny 大卫•杜楚尼 饰）和斯科莉（Gillian Anderson 吉莲•安德森 饰）被分隔。穆德受命履行监听事情，斯科莉则回到学院读书。
某日国会议员麦特森（Raymond J. Barry 饰）向穆德透露一条消息，称在波多黎各领受到外星人的电讯。为了在特种部队之前找到外星人的证据，穆德只身前去。得知消息的斯科莉赶到穆德住处，从电脑中的搭客名单中找到线索，尾随来到波多黎各。
在波多黎各阿雷希伯，穆德偶遇一个本地人，并从他手里获得一幅外星人的画。但不久后此人便离奇死去。穆德终极能否找到外星人来访的证据？
