风和日丽的一天，铃木财团巨资营建的铃木塔进行了盛大的揭幕仪式。柯南（高山南 配音）和洽同伙们自然受邀参观。谁知一位游客突然被远处建筑发射来的枪弹狙击身亡，柯南锁定凶手果断睁开追击，然而对方胆大非常，果然炸毁阻挡他的警车，在重重围困中脱身而去。在此以后，FBI和日本警方组成联合调查总部，经朱蒂•斯泰琳（一城美由希 配音）先容得知，嫌疑人极可能是原美国海豹突击队狙击手蒂莫西·亨特。军功显赫的亨特已经获得过银星勋章，可是后来被战友指控违反交兵原则，射杀了赤手空拳的布衣，此后他更在疆场上遭遇影响终生的创痛，人生也彻底跌入低谷。此番他以神秘狙击手的出现，显然是想想那些扑灭了他的人生的人们复仇。
狙击事务接连而起，全东京陷入莫大的发急当中……
